קיבוץ ניר יצחק נוסד בתאריך י"ז כסלו תש"י - 8.12.1949.
החברים הראשונים הגיעו לקיבוץ לאחר תקופת הכשרה בקיבוץ גת, כולם בוגרי תנועת "השומר הצעיר" חניכי חברות נוער (שעלו לארץ מאירופה). אליהם הצטרפו עוד "גרעינים" (קבוצות חניכים בוגרים) מהתנועה בארץ ומארגנטינה. הקיבוץ נמצא בנגב המערבי, בצומת הגבולות עם מצריים והאוטונומיה הפלשתינאית (לשעבר - רצועת עזה).

בתחילה היה שמו: "קיבוץ ט"ו" ולאחר כמה שנים הוסב שמו של הקיבוץ ל - "ניר יצחק" על שם יצחק שדה, מפקד הפלמ"ח. במשך השנים, גדלה אוכלוסיית הקיבוץ. מסורת הקליטה נשמרה , לקיבוץ הגיעו "גרעינים" רבים ונוספו גם נקלטים "בודדים" - אם בשל נישואים או כמשפחה. כמו כן, בני הקיבוץ שבגרו, הקימו כאן את ביתם.

היום מונה אוכלוסיית הקיבוץ כ - 600 נפשות : 380 חברים, מועמדים (חיילים, צעירים לאחר הצבא) והורי חברים,
220 ילדים, מגיל 0 עד 18. הקיבוץ שוכן בתחום המועצה האזורית אשכול על שם ראש הממשלה לוי אשכול ז"ל.
תמונת החריש בשדה עם הגמל הפכה לסמל הקיבוץ (ה"לוגו" שלנו).